1作用方式不同
草甘膦是甘氨酸类，作用机理——抑制烯醇丙酮基莽草素磷酸合成酶，蛋白质合成受阻；草甘膦为内吸传导型广谱灭生性除草剂，通过茎叶传导到地下部，对深根杂草的地下组织破坏力强，能达到一般农业机械无法达到的深度。
草铵膦是膦酸类，作用机理——积铵触杀，抑制谷氨酰胺合成。草铵膦为膦酸类非选择性传导型除草剂，通过抑制谷氨酸合成酶这一植物的重要解毒酶作用，导致植物体内氮代谢紊乱，铵过量积累，叶绿体解体，从而使植物光合作用受抑制，最终导致杂草死亡。
2传导方式不一样
草甘膦是内吸传导灭生；
草胺膦是半内吸或内吸很弱无传导的触杀灭生。
3除草效果不一样
草甘膦一般要7～10天见效；
草铵膦一般为3天（正常气温）。
从除草速度、除草效果、控制杂草再生时期等方面看，草铵膦的田间表现都很优异，随着草甘膦、百草枯的抗性杂草越来越严重，农民会因草铵膦卓越的防效及良好的环保性能而很易接受。对生态要求更安全的茶园、农场、绿色食品基地等，对草铵膦的需求也越来越大。
4除草范围不同
草甘膦对160多种杂草有防除作用，包括单子叶和双子叶、一年生和多年生、草本和灌木等植物，但它对部分多年恶性杂草防除效果不理想。对抗性恶性杂草如牛筋草、小飞蓬等，草甘膦效果不是很明显；草甘膦一般不能用于浅根或根系暴露在外的作物如香菜、胡椒、葡萄、木瓜等；
2、十大转基因蔬菜？1、木瓜，市场上卖的95%以上的木瓜都是，这或许出乎很多人的想象。
2、大豆及豆制品（包含大豆油）。玉米和玉米油。转基因菜籽出油率高，目前国家已经确认的是黄籽油菜渝黄1号和2号。
3、部分水稻及大米：在国内取得转基因大米合法种植权的地区是湖北，要警惕细长的很亮的米。容易与东北“长粒香”混淆。
4、大白菜：福山大包头，这是国家目前已经确认含有转基因的白菜品种
5、转基因胡萝卜：表面相对较光滑，一般是直的，它的尾部有时比中间还粗。且头部是往内凹的。非转基因胡萝卜：表面凸凹不平，一般不太直，从头部到尾部是从粗到细的。且头部是往外凸出来的。
6、转基因土豆：表面光滑，坑坑洼洼很浅，颜色比较淡，削皮之后，其表面无明显变化。非转基因土豆：样子比较难看，一般颜色比较深，表面坑坑洼洼的，同时表皮颜色不规则，削皮之后，其表面很快会颜色变深，皮内为白色。检验方法：先削皮后看变化再决定吃不吃。
7、转基因西红柿：颜色鲜红很好看，果实较硬，不易裂果。
3、国家让老百姓种植转基因粮食吗？国家允许，没有明确禁止。广大农民兄弟是适合种植转基因农作物的，为什么呢？理由如下：
大前提是一定要种植国家允种植的那些：大豆、玉米、油菜、棉花、番茄。今年国家农业农村部发布了2025年农业转基因生物监管工作方案，明确了2025年将对种子生产经营环节进行严格监管，严防非法进行转基因育种。转基因种子外包装都有标示，大家买的时候要注意看。
转基因农作物虫病少甚至不生虫，这就减少农药和人力的投入；虫害少自然产量就高，我们农民种植农作物不都希望产量高吗，还有转基因农作物是不长草的，这个更加减少对田地里的人力管理成本。转基因农作物不生其他**的，因为它改变了基因序列。
4、冬瓜是转基因吗？冬瓜还没有转基因的。
种植的转基因植物种类主要有：大豆（占54%），玉米（占28%），棉花（占9%），Canola油菜（占9%），马铃薯、西葫芦和木瓜的比例都小于1%。按转基因植物的性状划分，抗除草剂占71%，如抗除草剂的大豆（54%）、Canola油菜（9%）、玉米（4%）和棉花（4%）：抗虫转基因植物占22%，主要是抗虫玉米（19%）和抗虫棉（3%）；抗虫兼抗除草剂占7%，主要是抗虫兼抗除草剂的玉米（5%）和棉花（2%）；抗病毒和其它性状转基因植物的比例小于1%。
转基因植物(Transgeneplants)是拥有来自其他物种基因的植物。该基因变化过程可以来自不同物种之间的杂交，但今天该名词更多的特指那些在实验室里通过重组DNA技术人工插入其他物种基因以创造出拥有新特性的植物。
拓展好文：木瓜和除草剂——如何防止木瓜树的除草剂伤害
除草剂对木瓜造成损害的迹象可能因生长阶段、植株大小、温度、相对湿度、土壤湿度和所用除草剂的类型而异。木瓜除草剂伤害可能影响花朵、叶子、茎和果实。
木瓜除草剂药害的常见症状包括：
下部叶子呈杯状或卷曲斑驳和变色的叶子茎枯死病果实品质差水果上有斑点或雀斑，有时呈水浸状产量降低如果您的木瓜树受到除草剂的严重伤害，您可能无能为力，在某些情况下，损害可能会持续数年。
好消息是，接下来几个月的额外护理可能会将一棵轻度受损的树拉出危险区域。春季施肥并继续控制杂草。适当浇水，尤其是在干燥条件下。密切注意昆虫和**。
防止除草剂对木瓜造成损害包括仔细阅读并遵循产品标签上的说明。当风吹向木瓜树时，切勿使用除草剂。理想情况下，应在微风吹向相反方向时使用除草剂。
遵循有关温度的标签建议，以最大限度地降低蒸发风险。在两次使用之间彻底清洁水箱和喷雾器。该标签将提供有关实现此目标的最佳方法的建议。